虽然纯果汁比普通的果汁饮品具有更好的口味并保留了较多的维生素C，但它还是不能与水果等同，代替不了水果。
一方面，果汁中不含纤维素，而水果中都含有较多的纤维素。纤维素虽然不为人体消化吸收，但会增加肠道蠕动，促进排便。食物中缺乏纤维素不仅会引起肠功能紊乱，容易发生便秘，而且会使肠道内厌氧菌繁殖增多，有害物增多，这也是导致结肠癌的原因之一。
另一方面，果汁含糖量高，吃完饭再喝果汁，又会增加热量的摄入，这对于今天营养比较充足或需要减肥的人来说，显然不是理想的食品，而吃水果就无以上弊端。水果中保持着天然的营养物质，于健康十分有益，加之，吃水果时要增加牙的咀嚼力和面部肌肉的活动，增加唾液的分泌，这又有益于牙的健康和面部的美容，这些都是果汁代替不了的。
